Władze LTN-K stanowią: Walne Zgromadzenie Delegatów, które jest zwoływane raz na trzy lata. Walne Zgromadzenie wybiera na trzyletnie kadencje: Zarząd Główny prowadzący działalność Towarzystwa pomiędzy Walnymi Zgromadzeniami Delegatów, Główną Komisję Rewizyjną oraz Sąd Koleżeński.
Ostatnie XII Walne Zgromadzenie Delegatów LTN-K miało miejsce 26 listopada 2021 r. w siedzibie Towarzystwa, przy alei Wilanowskiej 204 w Warszawie.
Wybrano wówczas następujące władze:
Zarząd Główny Ludowego Towarzystwa Naukowo-Kulturalnego
Członkowie Zarządu:
Komisja Rewizyjna Ludowego Towarzystwa Naukowo-Kulturalnego
Sąd Koleżeński